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    3. 病毒基因組二代測序

      發布時間:2020-05-14 瀏覽次數:1473




      上海伯杰醫療科技有限公司構建的病毒二代測序平臺,樣品通過特殊處理、痕量病毒基因文庫的構建、深度測序和生物信息學分析等過程,大大提高樣品中病毒核酸檢測靈敏度和病毒全基因組覆蓋率。針對病原體含量低的臨床標本我公司建立了建庫前富集和捕獲平臺,提高病毒數據量。如近期為一客戶進行的登革病毒二代測序,收集的數據中病毒序列占93.9%,其中黃病毒屬全基因組的覆蓋率近100%,覆蓋的序列數達350000條。


      貨號

      產品名稱

      備注

      FW-CX-201

      病毒全基因二代測序(毒株)

      按照每株病毒收費

      FW-CX-201a

      病毒全基因二代測序(臨床標本)

      按照每株病毒收費

      FW-CX-202

      細菌框架圖二代測序(建庫+測序)

      按照每株細菌收費

      FW-CX-202a

      細菌框架圖測序A類分析

      按照每個原始數據收費

      FW-CX-202b

      細菌框架圖測序B類分析

      按照每個原始數據收費

      FW-CX-203

      細菌完成圖測序<7M(建庫+測序)

      按照每株細菌收費

      FW-CX-203a

      細細菌完成圖測序<7M(分析)

      按照每個原始數據收費

      FW-CX-204

      細菌完成圖測序>7M(建庫+測序)

      按照每個標本收費

      FW-CX-204a

      細菌完成圖測序>7M(分析)

      按照每個原始數據收費

      FW-CX-210

      病毒宏基因組測序-DNA病毒

      按照每個標本收費

      FW-CX-211

      病毒宏基因組測序-RNA病毒

      按照每個標本收費


      病毒基因組二代測序特色介紹:

      使用的儀器設備為ThermoFisher的Ion Torrent PGM工作平臺或Ilumina的 Miseq DX平臺,數據分析使用本公司生信人員搭建Pipeline,拼接病毒基因組使用的是業界主流軟件基礎上優化過的拼接方案,以denovo拼接為主;目前已經對A型流感病毒、B型流感病毒、腸道病毒A組、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、呼吸道腺病毒、偏肺病毒、札如入病毒、豬冠狀病毒、輪狀病毒A組、登革病毒、基孔肯亞病毒、日本腦炎病毒、新布尼亞病毒、諾如病毒、麻疹病毒,風疹病毒,腮腺炎丙肝病毒等進行了測序,可以聯系我公司銷售專員索要相關的參考報告格式。


      下面展示我公司出具測序報告的內容:

      該標本為臨床原始糞便標本,腸道通用試劑盒檢測陽性,標本Ct值為:28.16。

      下機數據的質量描述,包括下機數據統計和數據過濾兩塊內容。報告出示1個表4個圖,包括數據過濾統計(Q20)、序列質量分布箱線圖、堿基質量分布圖、堿基分布圖、GC含量分布圖。




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